Die mobile Phase durchströmt das Bett der stationären Phase in einer definierten Richtung. Die mobile Phase ist flüssig bei der Flüssigchromatographie (LC) , dann spricht man auch vom Eluenten, und der Dünnschichtchromatographie ( DC), dann spricht man vom Fließmittel. Die mobile Phase ist gasförmig bei der Gaschromatographie (GC) und wird dann auch Trägergas genannt. Wird als mobile Phase weitgehend ein überkritisches Fluid einsetzt, spricht man von überkritische Fluidchromatographie (Supercritical fluid chromatograpy, SFC) sein.
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